pyDeid

• pyDeid package
  • Subpackages
    • pyDeid.phi_types package
      • Submodules
      • pyDeid.phi_types.AddressPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.AmericanPIIFinder module
      • pyDeid.phi_types.DatesPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.EmailPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.HospitalNamePHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.MrnPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.NamesPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.OhipPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.PHITypeFinder module
      • pyDeid.phi_types.PostalCodePHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.SinPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.TelephoneFaxPHIFinder module
      • pyDeid.phi_types.utils module
      • Module contents
    • pyDeid.process_note package
      • Submodules
      • pyDeid.process_note.PHIFinder module
      • pyDeid.process_note.PHIHandler module
      • pyDeid.process_note.PHIPruner module
      • pyDeid.process_note.PHIReplacer module
      • Module contents
    • pyDeid.wordlists package
      • Module contents
  • Submodules
  • pyDeid.CSVEvaluator module
    • CSVEvaluator
      • CSVEvaluator.add_ground_truth_file()
      • CSVEvaluator.add_result_file()
      • CSVEvaluator.calculate_metrics()
      • CSVEvaluator.combine_files()
      • CSVEvaluator.evaluate()
      • CSVEvaluator.standardize_phi()
      • CSVEvaluator.validate_and_read_file()
    • melt_annotations()
    • tokenize_csv()
  • pyDeid.Deidentifier module
    • Deidentifier
      • Deidentifier.run()
  • pyDeid.cli module
  • pyDeid.n2c2 module
  • pyDeid.pyDeid module
    • deid_string()
    • display_deid()
    • pyDeid()
    • reid_string()
  • pyDeid.pyDeidBuilder module
    • pyDeidBuilder
      • pyDeidBuilder.build()
      • pyDeidBuilder.replace_phi()
      • pyDeidBuilder.set_custom_namelists()
      • pyDeidBuilder.set_custom_regex()
      • pyDeidBuilder.set_deid_output_file()
      • pyDeidBuilder.set_input_file()
      • pyDeidBuilder.set_max_field_size()
      • pyDeidBuilder.set_mll()
      • pyDeidBuilder.set_multithreading()
      • pyDeidBuilder.set_ner_pipeline()
      • pyDeidBuilder.set_phi_output_file()
      • pyDeidBuilder.set_phi_types()
      • pyDeidBuilder.set_valid_years()
  • Module contents